
Pilviškiai įsikūrę Šešupės ir Pilvės santakoje, 14 km į šiaurės rytus nuo Vilkaviškio, prie geležinkelio linijos Kaunas – Kybartai. Pilviškių seniūnija ribojasi su Gižų, Keturvalakių, Šeimenos ir Klausučių seniūnijomis, Šakių rajono, Kazlų Rūdos ir Marijampolės savivaldybėmis. Seniūnijos administracinis centras – Pilviškių miestelis. Seniūnijoje yra 67 kaimai, didesni iš jų – Stirnėnai, Paežeriai.